r - パッケージの作成

Question

R 言語でパッケージを作成しています。すべて正常に動作していますが、 R CMD check を実行すると、サンプルの実行中にエラー メッセージが表示されます。つまり、「ファイルを開くことができません。」「そのようなファイルやディレクトリはありません」実際には、関数には PubMed からの要約を含む PubMed テキスト ファイルが必要です。テキスト ファイルをパッケージのすべてのサブディレクトリに配置しましたが、機能しません。同じエラーが何度も表示されます。そのため、適切に実行するためにサンプルで使用できるパッケージにテキスト ファイルを配置する正しい方法を教えてください。私はあなたにとても感謝します。

Answer 1

通常、このようなデータは /inst フォルダーに配置します。例えば：

<packageRoot>/inst/pubmed/myfile

パッケージがビルドされた後、次のようにパッケージ内からこのフォルダーのコンテンツにアクセスできます。

system.file( "pubmed/myfile", package="<package>" )

詳細については、http ://cran.r-project.org/doc/manuals/r-release/R-exts.pdf (1.1.5 パッケージ内のデータ) を参照してください。