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wilcox テストを実行しましたが、p.value をリストまたはマトリックスに抽出したいと考えています。 

DF <- data.frame(A1=sample(1:9, 10, T),
                     A2=sample(1:9, 10, T),
                     A3=sample(1:9, 10, T),
                     B1=sample(1:9, 10, T),
                     B2=sample(1:9, 10, T),
                     B3=sample(1:9, 10, T))


sampA <- DF[,grep('A', names(DF))]  # Sample with columns A
sampB <- DF[,grep('B', names(DF))]  # Sample with columns B


lapply(1:nrow(DF), function(i){
  wilcox.test(as.numeric(sampA[i,]), as.numeric(sampB[i,]), exact=FALSE )
})

各行の wilcox テストの結果は次のようになります。リストまたはマトリックスの p.value を取得して Excel ファイルにエクスポートする方法を知りたいですか? [[1]]

    Wilcoxon rank sum test with continuity correction

data:  as.numeric(sampA[i, ]) and as.numeric(sampB[i, ]) 
W = 3, p-value = 0.6579
alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0 


[[2]]

    Wilcoxon rank sum test with continuity correction

data:  as.numeric(sampA[i, ]) and as.numeric(sampB[i, ]) 
W = 0, p-value = 0.0722
alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0 


[[3]]

    Wilcoxon rank sum test with continuity correction

data:  as.numeric(sampA[i, ]) and as.numeric(sampB[i, ]) 
W = 6, p-value = 0.6579
alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0
4

2 に答える 2

11

$p.valueオブジェクトから p.value を抽出するために追加するだけwilcox.testです:

lapply(1:nrow(DF), function(i){
  wilcox.test(as.numeric(sampA[i,]), as.numeric(sampB[i,]), exact=FALSE )$p.value
})

与える：

[[1]]
[1] 1

[[2]]
[1] 1

[[3]]
[1] 0.8247781

[[4]]
[1] 0.8247781

sapplyの代わりに 使用lapplyすると、リストの代わりにベクトルが取得され、操作が容易になります。

sapply(1:nrow(DF), function(i){
  wilcox.test(as.numeric(sampA[i,]), as.numeric(sampB[i,]), exact=FALSE )$p.value
}) 

# [1] 1.0000000 1.0000000 0.8247781 0.8247781 0.0765225 0.8247781 1.0000000
# [8] 0.8247781 0.2682859 0.0765225
于 2013-03-26T14:43:57.733 に答える
4

sapplyp.value 名を使用および参照...

sapply(1:nrow(DF), function(i){wilcox.test(as.numeric(sampA[i,]), as.numeric(sampB[i,]), exact=FALSE )$p.value})

#[1] 0.8247781 0.0765225 0.8247781 1.0000000 0.2682859 0.6625206 1.0000000
#[8] 0.1211833 0.5065552 0.8247781

これは、リストではなくベクトルを返します (たとえば、 を使用してリストにインデックスを付けることはできませんmylist[[1:5]]が、 を使用することはできますがmyvector[1:5]、それは個人的な好みです)。

于 2013-03-26T14:45:00.197 に答える