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system2() を使用して R 内から単純な python スクリプトを呼び出そうとしています。「あまりにも多くの」メモリが使用されている場合、それは機能しないという漠然とした情報を読みました。

大規模なデータセットをロードし、その中の情報を引数として使用して system2() に渡す場合、Rstudio の呼び出しで「R の再起動」を手動でクリックした場合にのみ機能します。

私が欲しいもの：

df <- read.csv('some_large_file.csv')
###extracting some info called 'args_vec'
for(arg in args_vec){
    system2('python', args)
}

このままではうまくいきません。for ループは単に渡されます。

必要なもの:

df <- read.csv('some_large_file.csv')
###extracting some info called 'args_vec'
###something that 'restarts' R
for(arg in args_vec){
    system2('python', args)
}

この答えは、私が望むものを完全には得ていません。つまり、Rstudio 内では機能せず、「system」を呼び出します (この場合、「system2」と同じ問題が発生します)。実際、上記の回答を Rprofile.site ファイルに入力すると、すぐに rstudio が閉じられました。

「makeActiveBinding」を使用するのではなく、通常の関数として提案を試みましたが、うまくいきませんでした。

##restart R in r session  -- doesn't work
makeActiveBinding("refresh", function() { system("R --save"); q("no") }, .GlobalEnv)

##nor did this:
refresh <- function() { system("R --save"); q("no") }

上記の 2 つのオプションのさまざまなバリエーションを試してみましたが、これは単純な質問のように思えて長くなりました。起動処理についてはまだわからないことが多く、「makeActiveBinding」がちょっと不思議です。誰かが私を正しい方向に向けることができますか?

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for ループではなく、適用関数内に関数呼び出しを埋め込んでみましたか?

私は、for ループでシステムのメモリを使い果たしたいくつかのコードを、apply で完全に実行しました。それは役立つかもしれませんか？

于 2014-04-14T13:01:14.430 に答える