CMT は、必要なトランザクション処理を透過的に提供する Java EE コンテナによって評価されるアノテーションを使用して宣言的に定義されます。Pojo はコンテナーによって管理されないため、CMT を適用することはできません。
エンティティに関する質問について。永続化ロジックの技術的な詳細を抽象化するために、DAO レイヤーを作成する必要があります。基本的に、1 つの汎用 dao 実装を使用して JPA をサポートできます。これは基本的に、2 つの環境で異なる必要がある唯一の部分です。コンテナーでは、注釈で定義されているように、トランザクションを無料で取得できます。標準の Java SE で実行している場合は、自分でトランザクションを開始/コミット/ロールバックする必要があります。
トランザクションを宣言的に定義し、コンテナー内で実行されることを期待する汎用的な dao 実装を作成することをお勧めします。Java SE で使用するために、コンテナが実際に行うことをエミュレートするために適切なトランザクション処理を処理するこの dao のデコレータがあります。
persistence.xml で何も変更する必要はないと思いますが、ここで間違っているかもしれません