私は次のクラスを持っています
queue = Queue.Queue()
class SpectraProcessing(threading.Thread):
def __init__(self, queue, pbar = None, image_infos = []):
threading.Thread.__init__(self)
self.queue = queue
self.pbar = pbar
self.image_infos = image_infos
def run(self):
while True:
spectrum = self.queue.get()
self.image_infos.append(get_spectrumInfos(spectrum))
#signal to queue job has been done
if self.pbar:
self.pbar.update(self.pbar.currval + 1)
self.queue.task_done()
msrun は、クラス Reader で作成された Spectrum オブジェクトに対する反復子です。
msrun = pimzml.run.Reader(file_imzML, file_ibd, MSn_Precision = 250e-6)
各スペクトル オブジェクトには、(最初は [] である) 強度 (float 値) を含む属性リストがあります。私の主な機能にはこれが含まれています:
number_spectra = len(msrun)
print "start creating the image from spectra..."
pbar = ProgressBar( maxval = number_spectra ).start()
#spawn a pool of threads, and pass them a queue instance
image_infos = []
for i in range(number_spectra):
t = SpectraProcessing(queue, pbar, image_infos)
t.setDaemon(True)
t.start()
#populate queue with data
for spectrum in msrun:
queue.put(spectrum)
#wait on the queue until everything has been processed
queue.join()
get_spectrumInfos(spectrum)
run メソッドによって呼び出される関数は、各スペクトルの強度のリストを処理します (リストを強度で埋めます...)。実行すると、強度のリストがNoneType(つまり、空)であるというエラーが表示されますが、エラーなしで実行される場合があります。Threads を使用しなくてもエラーは発生しません。
どうもありがとうございます。