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カーネルの起動update_umatrixに失敗し、プロファイラーは-100%! 計算の時間。

これはおそらく単純な問題ですが、私はそれに 2 週間を費やしましたが、nsight プロファイラーによると、カーネルの起動が何らかの形で開始されず、少なくともUマトリックスが更新されず、すべてゼロが含まれています (これは FCM の部分的な実装です)。

私の GPU は GeForce 330M で、Compute Capability は1.2です。

float *U;
float *V;
float *X;

__device__ float *U_d;
__device__ float *V_d;
__device__ float *X_d;

__global__ void update_umatrix(float *sqrerror,int C,int N,int S,float m)
{

    int i,j,k;
    int example_is_centroid;
    float summation, D_ki, D_kj;
    float newU;

    __shared__ float tmp_sqrerror[DIM];
    /* For each example in the dataset */
    k = threadIdx.x + blockIdx.x*blockDim.x;
    int local_offset = threadIdx.x;
    tmp_sqrerror[local_offset]=0;
        /* Special case: If Example is equal to a Cluster Centroid,
       then U=1.0 for that cluster and 0 for all others */
        if ( (example_is_centroid=is_example_centroid(k,S,C)) != -1 ) {
            for(int i=0; i<C; i++)
            {
            if ( i == example_is_centroid )
                U_d[k*C+i]=1.0;
            else
                U_d[k*C+i]=0.0;
            }
            return;
        }
    /* For each class */
    for(int i=0; i< C; i++)
    {
        summation=0;

        /* Calculate summation */
        for (j=0; j < C; j++) {
            D_ki=distance(X_d, V_d,k*DIM,i*S,S);
            D_kj=distance(X_d, V_d,k*DIM,j*S,S);
            summation += powf( D_ki / D_kj , (2.0/ (m-1)));
        }

        /* Weight is 1/sum */
        newU=1.0/summation;

        /* Add to the squareDifference */
        tmp_sqrerror[local_offset] += powf(U_d[k*C+i] - newU, 2);

        U_d[k*C+i]=newU;

    }
    __syncthreads();
    int t= blockDim.x/2;
    while(t>0)
    {
        if(k+t < N && threadIdx.x<t)
            tmp_sqrerror[local_offset] += tmp_sqrerror[local_offset+t];
        t/=2;
        __syncthreads();
    }

    if(threadIdx.x==0)
        sqrerror[blockIdx.x] = tmp_sqrerror[0];

}




int init()
{

float m = 2.0;
int C=2;
int S=2;
int N=340*340;
    int i,j;

    /* Allocate necessary storage */
    V=(float *)CALLOC(S*C, sizeof(float));

    U=(float *)CALLOC(C*N,sizeof(float));
    cudaGetErrorString(cudaMalloc(&U_d,N*C*sizeof(float)));
    cudaGetErrorString(cudaMalloc(&V_d,C*S*sizeof(float)));

    /* Place random values in V, then update U matrix based on it */
    srand48(seed);
    for (i=0; i < C; i++) {
        for (j=0; j < S; j++) {
            V[i*S+j]=drand48() * max_value[j];
        }
    }
    float *dummy;
    cudaMalloc(&dummy,N*sizeof(float));
    cudaGetErrorString(cudaMemcpyToSymbol(&V_d,V,C*S*sizeof(float),0,cudaMemcpyHostToDevice));
    /* Once values are populated in V, update the U Matrix for sane values */
    update_umatrix<<<(N+DIM-1)/DIM,DIM>>>(dummy,C,N,S,m);
    cudaGetErrorString(cudaGetLastError());
cudaDeviceSynchronize();

cudaGetErrorString(cudaMemcpyFromSymbol(U,&U_d,N*C*sizeof(float),cudaMemcpyDeviceToHost));
fprintf(stdout,"Initialization completed.\n");

    return 0;
}

ある i について X[k] == V[i] の場合、その i を返します。それ以外の場合は -1 を返します

__device__ int is_example_centroid(int k,int S, int C)
{
    int  i,x;

    for (i=0; i < C; i++) {
        for (x=0; x < S; x++) {
            if ( X_d[k*DIM+x] != V_d[i*S+x] ) break;
        }
        if ( x == S )  /* X==V */
            return i;
    }
    return -1;
}

そして距離関数:

__device__ float distance(float *v1, float *v2,int startV1,int startV2,int S)
{
    int x,i;
    float sum=0;

    for (x=startV1,i=startV2; x < startV1+DIM && i<startV2+S; x++, i++)
        sum += (v1[x] - v2[i]) * (v1[x] - v2[i]);

    return sqrt(sum);
}
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