setuptools のドキュメントには次のように記載されています。
最大限のパフォーマンスを得るには、Python パッケージを zip ファイルとしてインストールするのが最適です。ただし、すべてのパッケージが圧縮形式で実行できるわけではありません。これは、通常のオペレーティング システム ファイルとしてソース コードまたはデータ ファイルにアクセスできることを期待している場合があるためです。そのため、setuptools はプロジェクトを zip ファイルまたはディレクトリとしてインストールできます。デフォルトの選択は、プロジェクトの zip_safe フラグ (参照) によって決まります。
実際には、得られるパフォーマンス上の利点は何ですか? プロジェクトが zip セーフであるかどうか、または利点が一般的に最小限であるかどうかを調査する価値はありますか?