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私はいくつかの並列計算を行う予定で、この分野ではまったくの初心者です。MPI を使用して、Master-Slave モデルで並列作業を行います。現在、4 台のマシンがあり、そのうちの 1 台をマスター ノードにしたいと考えています。ただし、プログラムを実行している他のマシンを指定する方法がわかりません。スレーブノードのIPアドレスを指定する方法はありますか? プログラムを起動するには？Ubuntu 12.10 を使用しています。

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設定

すべてのノードでディレクトリ/ファイル構造が同じであることを確認してください。たとえば、実行可能ファイルは/home/yan/my_programすべてのコンピューターにある必要があります。たとえば、 NFS経由ですべてのコンピュータに同じディレクトリをマウントできます。

次のように、マスター ノードからすべてのスレーブ ノードにログインできるようにSSH をセットアップします。

yan@master:~/$ ssh slave1
yan@slave1:~/$

これは、ユーザーyanがすべてのコンピューターに存在する必要があることを意味します。SSH キーによるログインを設定した場合、パスワードを入力する必要はありません。パスワードでログインしている場合は、プログラムの起動時にパスワードを入力する必要があります。

を使用してOpenMPIをインストールします

sudo apt-get install penmpi-bin openmpi-doc libopenmpi-dev

代わりに、MPICH などの他の MPI 実装をインストールできます。

プログラムを実行

次に、プログラムをコンパイルしmpicc myprogram.c -o myprogram(C を使用している場合、C++mpic++などの場合)、次を使用して実行します。

yan@masternode:~/$ mpirun -n 4 -H master,slave1,slave2,slave3 myprogram

マシン名の代わりに、IP アドレスを使用することもできます。-nプロセス数を指定します。オプションを省略すると、各マシンで 1 つのプロセスが開始されます。マシンごとに複数のスロットを使用することもできます:

yan@masternode:~/$ mpirun -n 8 -H master,slave1,slave2,slave3,\
master,slave1,slave2,slave3 myprogram

または、1 行に 1 つのコンピューター名を に書き込んで、次のHOSTFILEように指定することもできます。

yan@masternode:~/$ mpirun -hostfile HOSTFILE

これらのコマンドは、SSH 経由でスレーブ コンピュータに自動的に接続し、プログラムを起動して通信パラメータを設定し、データ配信が自動的に機能するようにMPI_Comm_sizeしMPI_Comm_rankます。また、現在のコンピュータの数とクラスタのサイズが表示されます。

これらのオプションは、 を呼び出すことで表示できますman mpirun。

于 2013-04-09T14:55:32.520 に答える