異なる蛍光チャネルで複数の画像を撮影した場合 (抗体/マーカーで細胞を染色した後)、各マーカーに対して陽性の細胞の割合を自動的に定量化するにはどうすればよいですか? Pythonでこのようなことをした人はいますか?
フィジー (ImageJ) を使用して、1 つの染色タイプのみを含む細胞をカウントすることはできますが、2 つの染色タイプを含むマージされた画像に対して選択的なカウントを実行することはできません。フィジーは python とうまくやり取りするので、1 つの染色タイプのみを含むそれぞれの画像を見て、それぞれの画像の xy 座標を取得し、それらの間の一致をチェックするスクリプトを作成することを考えていました。それが良いアイデアかどうかはわかりませんが、誰かが似たようなことをしたり、タスクを完了するためのより効率的な方法を持っているかどうか疑問に思っていましたか?
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