genealogy - 近交係数の計算と系図ソフトウェア

Question

私は現在、非常に多くのGEDCOMファイル（約33,000個体）をマッピングし、祖先および個体の近交係数を計算できるソフトウェアを探しています。誰かができるソフトウェアを知っていますか????

ありがとう

Answer 1

GeneWeb (ML で記述) は、大きなファイルを非常にうまく処理し、高速な血族係数計算を行います。インポート時にデータベース内のすべての個人の血縁係数を計算すると思いますが、これは数秒以内に行われます。また、目立った遅延なしに、任意の深い祖先と子孫のツリーを表示します。

http://cristal.inria.fr/~ddr/GeneWeb/en/index.html#Par

また、任意の数の GEDCOM を処理することもできます。

Answer 2

これを行うソフトウェアは見つからないと思いますが、独自に作成するのはそれほど難しくありません。多くのオープン ソースの gedcom パーサーの 1 つを使用して、個人をNeo4jなどのグラフ データベースに追加します。Neo4j に入ると、個人に対して計算を実行するのは比較的簡単になるはずです。

Answer 3

Pypedal Python Pedigree Analysisは、家系図 の操作、家系図の簡単な視覚化、および家系図からの遺伝的多様性の尺度の計算のためのツールを提供する Python モジュールです。