作成したマルチプラットフォームの Adobe Air Native Extension (ANE) があります。ANE の Android 部分には、リソース (つまり、res/drawable、res/drawable-hdpi、res/layout、res/values) が含まれます。
ANE を作成すると、リソースが ANE に適切に含まれます。(これは、ANE を分解して判断したところ、適切なディレクトリにすべてのリソースが表示されます)
ただし、APK を作成すると、res/values ディレクトリを除くすべてのリソースが含まれます。そのディレクトリ全体とそのリソースは含まれていません。(APK をバラバラにして res ディレクトリを調べて、これを判断しました)
最終的な APK に ANE が含まれないようにする APK の Adobe パッケージングに特別な何かがあるかどうかは誰にもわかりませんか?