ルート web.config だけをスキップすることはできませんmsdeploy(ルートの下のサブフォルダーに存在する web.config ファイルを保持したい)
これは私が使用しているパラメータです:
-skip:objectName=filePath,absolutePath=^\\web\.config
を試してみましたが^\\web\.config、\\web\.configファイルへの絶対パスは次のとおりC:\\Some Path\\web\.configです。それらのどれも機能していないようです。