Python でダイナミック タイム ワーピングの簡単な実装を作成しましたが、ちょっとしたハックのように感じます。私は再帰関係を実装しました (または、少なくとも、実装したと思います!) が、私の場合、これには numpy 配列が含まれているため、メモ化を機能させるにはクラスでラップする必要がありました (numpy 配列は変更可能です)。
DTW への Wiki リンク: Dynamic Time Warping
コードは次のとおりです。
class DynamicTimeWarp(object):
def __init__(self, seq1, seq2):
self.warp_matrix = self.time_warp_matrix(seq1, seq2)
def time_warp_matrix(self, seq1, seq2):
output = np.zeros((len(seq1), len(seq2)), dtype=np.float64)
for i in range(len(seq1)):
for j in range(len(seq2)):
output[i][j] = np.sqrt((seq1[i] - seq2[j]) ** 2)
return output·
@lru_cache(maxsize=100)
def warp_path(self, i=None, j=None):
if (i is None) and (j is None):
i, j = self.warp_matrix.shape
i -= 1
j -= 1
distance = self.warp_matrix[i, j]
path = ((i, j),)
if i == j == 0:
return distance, path
potential = []
if i - 1 >= 0:
potential.append(self.warp_path(i-1, j))
if j - 1 >= 0:
potential.append(self.warp_path(i, j-1))
if (j - 1 >= 0) and (i - 1 >=0):
potential.append(self.warp_path(i-1, j-1))
if len(potential) > 0:
new_dist, new_path = min(potential, key = lambda x: x[0])
distance += new_dist
path = new_path + path
return distance, path
私の質問:
私が信じているように、これはDTWの有効な実装ですか?
numpy 配列の使用と再帰関係を維持しながら、これを行うより良い方法はありますか?
クラスを使用しなければならなくなり、クラスのインスタンスを再利用したい場合 (新しいシーケンスを渡し、warp_matrix を再計算することによって)、warp_path に引数として何らかのダミー値を渡す必要があります。関数 - そうでなければ、lru_cache が誤って値を返すと思います。この問題を回避するよりエレガントな方法はありますか?