次のようなファイル (test.bed) があります (タブ区切りではない可能性があります)。
chr1 10002 10116 id=1;frame=0;strand=+; 0 +
chr1 10116 10122 id=2;frame=0;strand=+; 0 +
chr1 10122 10128 id=3;frame=0;strand=+; 0 +
chr1 10128 10134 id=4;frame=0;strand=+; 0 +
chr1 10134 10140 id=5;frame=0;strand=+; 0 +
chr1 10140 10146 id=6;frame=0;strand=+; 0 +
chr1 10146 10182 id=7;frame=0;strand=+; 0 +
chr1 10182 10188 id=8;frame=0;strand=+; 0 +
chr1 10188 10194 id=9;frame=0;strand=+; 0 +
chr1 10194 10200 id=10;frame=0;strand=+; 0 +
次の出力を生成したい (タブ区切りにする必要があります):
chr1 10002 10116 id=1 0 +
chr1 10116 10122 id=2 0 +
chr1 10122 10128 id=3 0 +
chr1 10128 10134 id=4 0 +
chr1 10134 10140 id=5 0 +
chr1 10140 10146 id=6 0 +
chr1 10146 10182 id=7 0 +
chr1 10182 10188 id=8 0 +
chr1 10188 10194 id=9 0 +
chr1 10194 10200 id=10 0 +
私は次のコードで試しました：
awk 'OFS="\t" split ($0, a, ";"){print a[1],$5,$6}' test.bed
しかし、私は得る：
chr1 10002 10116 id=1 40 4+
chr1 10116 10122 id=2 40 4+
chr1 10122 10128 id=3 40 4+
chr1 10128 10134 id=4 40 4+
chr1 10134 10140 id=5 40 4+
chr1 10140 10146 id=6 40 4+
chr1 10146 10182 id=7 40 4+
chr1 10182 10188 id=8 40 4+
chr1 10188 10194 id=9 40 4+
chr1 10194 10200 id=10 40 4+
私は何を間違っていますか？どういうわけか、最後の 2 つのフィールドに数字「4」が追加されます。数字「4」は、4 番目のフィールドでの分割と何らかの関係があるのではないかと考えましたが、分割されたのが 3 番目のフィールドである同様のファイルを作成しようとしましたが、最後に数字「4」が追加されました。 2 つのフィールド。私は「awk」にかなり慣れていないので、構文のエラーだと思います。どんな助けでも大歓迎です。