私は自分のアプリ (興味があるならhttp://audulus.com ) で JACK ( http://www.crudebyte.com/jack-ios/ ) のサポートを実装しています。
JACK アプリには、接続されている他のアプリ (私のものなど) を終了するための UI があります。JACK からの通知を受け取ったら、プログラムでアプリを終了することになっています。
JACK には、アプリを終了するのではなく、アプリを切断するための UI が必要ですか?
関連情報:
http://developer.apple.com/library/ios/#qa/qa1561/_index.html
http://developer.apple.com/library/ios/#documentation/userexperience/conceptual/mobilehig/Introduction/Introduction.html「プログラムで終了しない」を参照