.NET Framework が利用できない場合に、それらをダウンロードしてインストールする方法については、不完全な質問と回答が多数ありますが、インターネット上で完全なコードを利用できるようには見えません。
setup.exe/MSI を生成する最小限のコンパイル可能なコードまたは明確な例へのリンクを提供できますか? MSI とブートストラップのインストーラーには、簡単に推測できない多くの特異性があるため、RTFM はこの質問には当てはまらないと思います。
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