私のコードや CSS に問題があるのではないかと思いましたが、JSFiddle で再現できます。
<body>
<div data-role="page" id="index">
<div style="padding:20px">
<div>Here's the problem - this dynamicaly populated collapsable set should have rounded corners:</div>
<div id="output" data-role="collapsible-set" data-inset="true" data-theme="c"></div>
<div>If I use the same content but do not render it dynamically, it is fine:</div>
<div id="static" data-role="collapsible-set" data-inset="true" data-theme="c">
<div data-role="collapsible">
<h2>Container 1</h2>
<ul data-role="listview" data-filter="true" data-filter-theme="c" data-divider-theme="d"></ul>
</div>
<div data-role="collapsible">
<h2>Container 2</h2>
<ul data-role="listview" data-filter="true" data-filter-theme="c" data-divider-theme="d" start="" id="category-0" end="">
<li><a onclick="email_choose_template.selectTemplate(0)" href="javascript:void(0)" style="padding-left:62px"><img src="../../images/email_icon.png" style="width:40px; height:42px; float:left; margin-left:10px; margin-top:4px; "><h3 style="font-size:12px;">Template 1</h3></a>
</li>
<li><a onclick="email_choose_template.selectTemplate(1)" href="javascript:void(0)" style="padding-left:62px"><img src="../../images/email_icon.png" style="width:40px; height:42px; float:left; margin-left:10px; margin-top:4px; "><h3 style="font-size:12px;">Template 2</h3></a>
</li>
</div>
<div>Why the difference?</div>
</div>
</body>
<script>
$('#output').append('<div data-role="collapsible"><h2>Container 1</h2><ul data-role="listview" data-filter="true" data-filter-theme="c" data-divider-theme="d"></ul></div><div data-role="collapsible"><h2>Container 2</h2><ul data-role="listview" data-filter="true" data-filter-theme="c" data-divider-theme="d" start="" id="category-0" end=""><li><a onclick="email_choose_template.selectTemplate(0)" href="javascript:void(0)" style="padding-left:62px"><img src="../../images/email_icon.png" style="width:40px; height:42px; float:left; margin-left:10px; margin-top:4px; "><h3 style="font-size:12px;">Template 1</h3></a></li><li><a onclick="email_choose_template.selectTemplate(1)" href="javascript:void(0)" style="padding-left:62px"><img src="../../images/email_icon.png" style="width:40px; height:42px; float:left; margin-left:10px; margin-top:4px; "><h3 style="font-size:12px;">Template 2</h3></a></li>');
$('#output').trigger('create');
</script>
折りたたみ可能なセットで trigger('create') を実行すると、角を丸くする必要がある最初の子と最後の子にフラグを立てることができないようです。
何か案は?レンダリング後に自分でクラスを手動で適用することを除いて、アイデアが不足しています..