スキンを使用すると、シェイプ レンダラーで描画したシェイプが表示されません。シェイプは、ShapeRenderer のインスタンスを使用してアクター内に描画されます。空のテーブルを追加してシェイプが表示されるため、これはスキンが原因だと思いますが、スキンのインスタンスを追加するとシェイプが表示されません。
このコードは、github の libgdx テストからのものです。
Skin skin = new Skin(Gdx.files.internal("data/uiskin.json"));
Label nameLabel = new Label("Name:", skin);
Table t1 = new Table();
t1.setFillParent(true);
t1.add(nameLabel);
stage.addActor(t1);