これを複数選択で実行してみました。
$('#field-participants').trigger('liszt:updated');
運がなければ。何が欠けているのかわからない。複数選択以外でも機能します。id は select 要素のものです。新しいオプションが ajax 経由で追加されました。ここのドキュメントは、動作するはずだと言っていますhttp://harvesthq.github.io/chosen/
編集:
さらにコードを追加します。このコードは、私の ajax リクエストの成功ハンドラーによって呼び出されます。選択は更新されますが、選択された部分は更新されません
updateParticipants: function(data) {
var $select = $('#field-participants');
$select.append(
$('<option></option>')
.val(data.value)
.html(data.name));
$select.trigger('liszt:updated');
}