そこで、Perl を使用して次の XML コードを解析し、スペクトルの結果を呼び出そうとしていますが、ハッシュであるため問題が発生しています。偶数サイズのリストが期待される場所でエラーメッセージの参照が見つかりました。
<message>
<cmd id="result_data">
<result-file-header>
<path>String</path>
<duration>Float</duration>
<spectra-count>Integer</spectra-count>
</result-file-header>
<scan-results count="Integer">
<scan-result>
<spectrum-index>Integer</spectrum-index>
<time-stamp>Integer</time-stamp>
<tic>Float</tic>
<start-mass>Float</start-mass>
<stop-mass>Float</stop-mass>
<spectrum count="Integer">mass,abundance;mass1,abundance1;
mass2,abundance2</spectrum>
</scan-result>
<scan-result>
<spectrum-index>Integer</spectrum-index>
<time-stamp>Integer</time-stamp>
<tic>Float</tic>
<start-mass>Float</start-mass>
<stop-mass>Float</stop-mass>
<spectrum count="Integer">mass3,abundance3;mass4,abundance4;
mass5,abundance5</spectrum>
</scan-result>
</scan-results>
</cmd>
</message>
私が使用しているPerlコードは次のとおりです。
my $file = "gapiparseddataexample1.txt";
unless(open FILE, '>'.$file) {
die "\nUnable to create $file\n";
}
use warnings;
use XML::Simple;
use Data::Dumper;
my $values= XMLin('samplegapi.xml', ForceArray => [ 'scan-result' ,'result-file-header']);
print Dumper($values);
my $results = $values->{'cmd'}->{'scan-results'}->{'scan-result'};
my $results1=$values->{'cmd'}->{'result-file-header'};
for my $data (@$results) {
print FILE "Spectrum Index",":",$data->{"spectrum-index"},"\n";
print FILE "Total Ion Count",":",$data->{tic},"\n";
%spectrum=$data->{spectrum};
print FILE "Spectrum",":",%spectrum, "\n";
for my $data1 (@$results1) {
print FILE "Duration",":",$data1->{duration},"\n";
}
}
スペクトル値のペアを印刷できるようにしたいと考えています。