エキスパートヘルパーの皆様、こんにちは。
これは投稿された最初の質問であり、他の質問に対してすばらしい回答が寄せられていることがわかります。私の質問は以下です。
DNA配列（SNP：SNP：各SNPに固有の固有IDを持つSingle Nucleotide Polymorphisms）に関するクエリを処理した結果（出力）を、処理を提供しているWebサイト（FASTSNP Webサイトなど）でランキング形式で抽出したい特定の SNP を取得し、抽出した結果を MySQL データベースに保存できるようにします。正規表現やその他の PHP や Perl (out コマンド) を使用する方法はありますか?実行したことがある人は助けてください。
前もって感謝します！
スタックオーバーフローへようこそ! まず、@amon を 2 番目に付けたいと思います。コードのアイデアがあれば、投稿してください。それ以外の場合は、より正確な質問を作成する必要があります。とはいえ、とにかく答えを出そうとします。さらに仕様があれば更新できます。
シーケンス、またはさらに一般的に言えばバイオインフォマティクスを扱っている場合は、間違いなくBioperlを確認する必要があります。バイオインフォマティクスで最も一般的に使用されるデータ形式のインターフェイスが付属しており、データベースなどの特定のオンライン リソースへのインターフェイスも備えています。そして、一般的にデータベースとやり取りするための Perl モジュールがあります。SQL データベースの場合、SQL::DBがおそらく良い出発点になると思いますが、これまでのところ、私自身はそれを使用したことがありません。
perl を使用することをお勧めします。
WWW::Mechanizeは、クエリを実行して結果を取得できます。submit_form メソッドがあります。リンクされたページの簡単な例 (概要) は、その方法を示しています。
結果が得られたら、並べ替えを使用して、必要に応じて結果を並べ替えることができます。
データベース アクセス用の優れたモジュールも多数あります。
FASTSNP サイトに送信するクエリの例を投稿できますか?