私は現在iOS 6 プロジェクトに取り組んでおり、間もなく準備が整います。開発者が iOS 7 を利用できるようになったので、アプリを iOS 7 対応にする予定です。
...しかし、Xcode 5 ベータ版で編集されたペン先またはストーリーボードは、Xcode 4 で開くことができなくなりました。また、アプリを Xcode 5 ベータ版でアプリ ストアに送信できないため、この問題のベスト プラクティスは何ですか?
ベスト プラクティスは、公式リリースまで待つことです。それまでは変更される可能性があるためです。実際には、ソフトウェアのベータ版のみを使用してテストする必要があります。Xcode の最新リリース バージョンに観察結果を適用するか、Xcode 5 が正式にリリースされるまで送信を待つことができます。
ツールバーなどの新しい UI に関する知識があれば、iOS7 に簡単に移行できるように、Xcode 4、iOS6 でアプリを設計できるはずです。自動レイアウトを使用すると、問題がはるかに少なくなります。