R で遺伝子レベルの分析スクリプトを作成していて、大量のデータを処理する必要があります。
私の最初のアイデアは、リスト内のリストのセットであるスーパー リスト構造を作成することでした。基本的にその構造は
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list[[1:8]][[1:1000]][[1:6]][[1:1000]]
これは巨大で、データ構造をセットアップするだけで 12 分以上かかります。このプロセスを並べると、1:8 リストの 1 つの値を設定するときに約 1.6 分に短縮できるので、基本的には...
#1.6 mins
list[[1:1]][[1:1000]][[1:6]][[1:1000]]
通常、必要に応じてその場で構造を作成しますが、1:1000 のステップを配布しているため、どの順序で戻ってくるかわかりません。
このレベルのデータの作成を処理するための他のパッケージはありますか? 私のアプローチでより効率的なデータ構造を使用できますか?
これが完全に間違ったアプローチのように思えたら申し訳ありませんが、R でビッグデータを扱うのはこれが初めてです。