私はRが初めてで、バイオストリング関数readFASTAに問題があります。の biostrings の最新バージョンR 3.0.1
は異なります。以前のバージョンは仕事をしているようです。したがってread.fasta
、seqin R からの関数の使用を開始しました。fasta ファイルから DNA シーケンスを読み込んでいます。
readFASTA
次のようにシーケンスを読みます
[[9999]]
[[9999]]$desc
[1] "9320"
[[9999]]$seq
[1]
"TCCCCTGAAATTCCCCC"
今read.fasta
、シーケンスを次のように読んでいます
[[4746]]
[1] "AACACAACCTCATTCCC"
以前のバージョンで演算子を使用する$
と、シーケンスと遺伝子 ID を分割できましたが、現在のバージョンではどうすればよいかわかりません。とにかく、から得ていたのと同じ出力を得ることができますかreadFASTA
。