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以下に示す 3 番目の列で示されているように、ggplot2 を使用して 2 つの異なる種の箱ひげ図の比較を行っています。

> library(reshape2)
> library(ggplot2)
> melt.data = melt(actb.raw.data)

> head(actb.raw.data)
  region  expression species
1     CG -0.17686667   human
2     CG -0.06506667   human
3     DG  1.04590000   human
4    CA1  1.94093333   human
5    CA2  1.55023333   human
6    CA3  1.75800000   human

> head(melt.data)
  region species   variable       value
1     CG   human expression -0.17686667
2     CG   human expression -0.06506667
3     DG   human expression  1.04590000
4    CA1   human expression  1.94093333
5    CA2   human expression  1.55023333
6    CA3   human expression  1.75800000

ただし、次のコードを実行すると:

ggplot(combined.data, aes(x = region, y = expression, fill = species)) +
+     geom_boxplot() +
+     scale_fill_manual(values = c("yellow", "orange"))
+     ggtitle("Expression comparisons for ACTB")
+     theme(axis.text.x = element_text(angle=90, face="bold", colour="black"))

次のエラーが表示されます。

> ggplot(actb.raw.data, aes(x = region, y = expression, fill = species)) +
+     + geom_boxplot() +
+     + scale_fill_manual(values = c("yellow", "orange"))
Error in +geom_boxplot() : invalid argument to unary operator
> + ggtitle("ACTB expression in human vs. macaque")
Error in +ggtitle("ACTB expression in human vs. macaque") : 
 invalid argument to unary operator
> + theme(axis.text.x = element_text(angle=90, face="bold", colour="black"))
Error in inherits(x, "theme") : argument "e2" is missing, with no default

これは、値が何であれ、変数melt.dataを使用して実行したときにも発生します。誰かがこれを修正するのを手伝ってくれますか? 以前、同じようにフォーマットされた別のデータセットを使用してこのコードを正常に実行したことがありますが、ここで何が問題なのかわかりません。

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+各行の先頭にエクストラを挿入したように見えますが、これは R が単項演算子として解釈しています (-減算ではなく否定として解釈されるように)。うまくいくのは

ggplot(combined.data, aes(x = region, y = expression, fill = species)) +
    geom_boxplot() +
    scale_fill_manual(values = c("yellow", "orange")) + 
    ggtitle("Expression comparisons for ACTB") + 
    theme(axis.text.x = element_text(angle=90, face="bold", colour="black"))

おそらく、R コンソールの出力からコピーして貼り付けましたか? コンソールは+、入力が不完全な場合に行頭で使用します。

于 2013-06-21T17:01:23.853 に答える