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ノードの場合、nodesepノード間のスペースを増やすものがあります。のような属性はありますsubgraph clusterか?
nodesep
subgraph cluster
margin各クラスター内でオプションを設定します。これはクラスターを分離しませんが、最も近いノード間にスペースを追加します。特に を使用している場合は、これで十分な場合がありますstyle=invis。
margin
style=invis