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次のようなデータセットがあります。

region    expression    species/gene
reg1      4             humanA
reg1      5             humanB
reg1      4             ratA
reg1      6             ratB
reg2      3             humanA
reg2      5             humanB
reg2      8             ratA
reg2      2             ratB

ここで、x 軸に region1-n を、y 軸に発現値をプロットし、種/遺伝子の値で色分けします。また、各種/遺伝子グループの傾向線をプロットし、余白に r 値を表示したいと考えています。理想的には、次の形式のものを使用します

ggplot(data, aes(x=xvar, y=yvar)) +
geom_point(shape=1) +    
geom_smooth(method=lm) +
geom_point(shape=19, alpha=1/4)

しかし、私はこれを自分のデータと絡ませる方法を理解するにはあまりにも慎重です。前もって感謝します！

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たとえば、これを試してください：

library(ggplot2)
ggplot(dat,aes(x=region,y=expression,
   group=species.gene,color=species.gene)) + 
  geom_line()

ここに画像の説明を入力

于 2013-06-25T22:18:15.373 に答える