最初の遭遇の後、パターン 1 からパターン 2 までの検索を停止するように awk に指示できるかどうか疑問に思っていました。私がスキャンしているファイルには 4 GB のテキストが含まれており、awk コマンドを繰り返すたびに計算に 1 分ほどかかり、100 万回実行する必要があるためです。文字通り百万回。
最適化しようとしている行は次のようになります。
awk "/MODEL ${j}/,/ENDMDL/" j=$j filename.pdb > outputfile.txt
よろしくお願いいたします。