scipy で使用される適合アルゴリズムについて質問があります。私のプログラムでは、y エラーのみの x および y データ ポイントのセットがあり、関数を当てはめたいと考えています。
f(x) = (a[0] - a[1])/(1+np.exp(x-a[2])/a[3]) + a[1]
それに。
問題は、2 つのフィット scipy フィット ルーチン scipy.odr.ODR (最小二乗アルゴリズムを使用) と scipy.optimize を使用して、パラメーターにとてつもなく高いエラーが発生し、フィット パラメーターにも異なる値とエラーが発生することです。私の例を挙げます:
scipy.odr.ODR に適合、fit_type=2
Beta: [ 11.96765963 68.98892582 100.20926023 0.60793377]
Beta Std Error: [ 4.67560801e-01 3.37133614e+00 8.06031988e+04 4.90014367e+04]
Beta Covariance: [[ 3.49790629e-02 1.14441187e-02 -1.92963671e+02 1.17312104e+02]
[ 1.14441187e-02 1.81859542e+00 -5.93424196e+03 3.60765567e+03]
[ -1.92963671e+02 -5.93424196e+03 1.03952883e+09 -6.31965068e+08]
[ 1.17312104e+02 3.60765567e+03 -6.31965068e+08 3.84193143e+08]]
Residual Variance: 6.24982731975
Inverse Condition #: 1.61472215874e-08
Reason(s) for Halting:
Sum of squares convergence
次に、scipy.optimize.leastsquares との適合:
scipy.optimize.leastsq に適合
beta: [ 11.9671859 68.98445306 99.43252045 1.32131099]
Beta Std Error: [0.195503 1.384838 34.891521 45.950556]
Beta Covariance: [[ 3.82214235e-02 -1.05423284e-02 -1.99742825e+00 2.63681933e+00]
[ -1.05423284e-02 1.91777505e+00 1.27300761e+01 -1.67054172e+01]
[ -1.99742825e+00 1.27300761e+01 1.21741826e+03 -1.60328181e+03]
[ 2.63681933e+00 -1.67054172e+01 -1.60328181e+03 2.11145361e+03]]
Residual Variance: 6.24982904455 (calulated by me)
My Point は 3 番目の適合パラメーターです。結果は次のとおりです。
scipy.odr.ODR、fit_type=2:
C = 100.209 +/- 80600
scipy.optimize.leastsq:
C = 99.432 +/- 12.730
なぜ最初のエラーがこれほど高いのかわかりません。さらに良いことに、エラーのあるまったく同じデータ ポイントを Origin 9 に入れると、C = x0 = 99,41849 +/- 0,20283 が得られます。
再びまったく同じデータを c++ ROOT Cern C = 99.85+/- 1.373 に
ROOT と Python でまったく同じ初期変数を使用しましたが。オリジンは必要ありません。
なぜこれが起こるのか、そしてどれが最良の結果なのか、何か手がかりはありますか?
ペーストビンにコードを追加しました:
助けてくれてありがとう!
編集:SirJohnFranklinsの投稿に関連するプロットは次のとおりです。