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マンハッタン プロットで R のデータをプロットしていますが、データのサブカテゴリごとに異なる色を使用しています。残念ながら、プロットで明確にしたいサブカテゴリの 1 つは、本当にかすかな黄色です。そのサブカテゴリが黄色になるのを避けるため、または黄色を除外するためだけに、色の順序を変更する方法はありますか? どちらのソリューションも機能します。

私の現在のコマンドは次のようなものです：

 plot(-log10(1-emp_dis_Fst(xdata[,"MEAN_FST_TAME_AGGRESSIVE"])), col=xdata$CHROM, pch=16)

よろしくお願いいたします。

ルバル

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R に 1 つのカテゴリを特別に扱うように指示することもできます。

plot(-log10(1-emp_dis_Fst(xdata[,"MEAN_FST_TAME_AGGRESSIVE"]))
     ,col=ifelse(xdata$CHROM==badCategory,"red",xdata$CHROM
     , pch=16)

簡単な例を次に示します

x = rnorm(10)
y = rnorm(10)
colr = seq(from=1, to=5)

plot(x,y, col=colr)
plot(x,y, col=ifelse(colr==3, "purple", colr))
于 2013-07-05T15:11:18.217 に答える