c++ - C ++でのpedファイルの読み取り.

Question

ped ファイル ( http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/data.shtml#ped ) を読み取るための C++ ライブラリはありますか?

Answer 1

PED から BED ファイルへの変換

To convert myPlinkTextData.ped and myPlinkTextData.map in Plink binary format, use Plink as follows:
plink --file myPlinkTextData --make-bed --out myPlinkBinaryData 

ソース: http://www.shapeit.fr/pages/m02_formats/pedmap.html

BED ファイルを読み取るためのライブラリ

https://github.com/fadern/libplinkio (vinash85 コメントより)

PED ファイルの読み取りはロードマップ (1.0) にあるようですが、いつ、または 1.0 に到達するかについての情報は見つかりませんでした。

独自の PED ファイル ライブラリを作成する

plinkコマンド ライン ツールのソース コードは次の場所で入手できます。

http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/download.shtml

したがって、すべてを行う単一のライブラリが必要な場合は、その一部を取得して、libplinkioそれらを組み合わせることができます。