Web アプリの web.xml に、Web アプリの lib ディレクトリに追加する jar ファイル内のディレクトリ構造を使用するフィルターを追加する必要があります。
<filter>
<filter-name>monitor</filter-name>
<filter-class>com.student.compute</filter-class>
</filter>
<filter-mapping>
<filter-name>monitor</filter-name>
<url-pattern>/*</url-pattern>
</filter-mapping>
ここで、フィルターは jar ファイル内の com.student パッケージの「compute」クラスを使用しています。jarファイルを展開して、この構造が存在するか確認しました。
これで、classes ディレクトリにも、アプリケーション固有の多くのクラスを格納する com ディレクトリがあります。
これで、Web アプリケーションのコンテンツにアクセスしようとしたときに、jar ファイル内の com とクラス ディレクトリ内の com が衝突しなくなりました。
どうか明らかにしてください。