別の div から高さを取得して div の高さを設定しようとしていますが、高さを使用していないようです。
$(".question-toggler").click(function() {
$("#main-content-pane").height()
$(".zebra-helper").fadeToggle("slow", "linear").height("#main-content-pane");
});
$(".handler").click(function() {
$(".zebra-helper").hide("slow", "linear");
});