r - テーブルを行と列の行列に変換する

Question

行と列のマトリックスに変換したいテーブルがあります：

x=read.table("file")
10716052        AF004884    2       AutonomicNervousDisorders
10716052        AF004884    11      CardiovascularDisorders
10716052        AF004884    9       GastrointestinalDisorders
10716052        AF004884    2       Hemorrhage
10716052        AF004884    1       MetabolicandNutritionalDisorders
10716052        AF004884    2       Musculo-skeletalSystem
10716052        AF004884    5       NervousSystem
10716052        AF004884    4       OphthalmicDisorders
10716052        AF004884    7       PathologicalDisorders
10716052        AF004884    5       PulmonaryDisorders
10716052        AF004884    2       RespiratorySystem
10716052        AF004884    3       SkinandAppendages
10716052        AJ251368    2       AutonomicNervousDisorders
10716052        AJ251368    11      CardiovascularDisorders
10716052        AJ251368    9       GastrointestinalDisorders
10716052        AJ251368    2       Hemorrhage
10716052        AJ251368    1       MetabolicandNutritionalDisorders

Rで「ライブラリリシェイプ」を使用するというこの投稿をフォローしています。

library(reshape)
cast(x, V1 ~ V2)

しかし、私は追加の結果を得ています:

        V1 AF004884 AJ251368 AJ272268 L35901 M65212
1 10716052       12       12       12     12      1

列名の各インスタンスが異なるカテゴリに属しているため、それぞれの数を付けたいと思います。