dtd ファイルへの参照を含む xml ファイルがあります。
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE varman SYSTEM "referenced.dtd">
...
このファイルを JAXP で読み取ることができましたが、referenced.dtd が xml ファイルと同じフォルダーにある場合に限られます。そうしないと、dtd ファイルを読み込めないという例外が発生します。そして、この不足しているリソースを解決するためにハンドラーを挿入する場所や何かを見つけることができませんでした。悟りをください!