「アカウント」と「月」で「合計」列を合計する必要があります。アカウントと月の組み合わせごとに1行が必要です
SELECT
'NPI' as Company, SYACTFIL_SQL.acc`enter code here`t_desc as Description ,
left(GLTRXFIL_SQL.mn_no,5) + '-' + left(GLTRXFIL_SQL.sb_no,4) as Account,
right(left(GLTRXFIL_SQL.trx_dt,6),2) as Month, SUM(GLTRXFIL_SQL.trx_amt) as Total
FROM Data.dbo.GLTRXFIL_SQL GLTRXFIL_SQL,Data.dbo.SYACTFIL_SQL SYACTFIL_SQL
WHERE GLTRXFIL_SQL.mn_no = SYACTFIL_SQL.mn_no AND
GLTRXFIL_SQL.sb_no`enter code here` = SYACTFIL_SQL.sb_no AND
(GLTRXFIL_SQL.trx_dt>=20130101) AND (GLTRXFIL_SQL.trx_dt<=20130630) AND
SYACTFIL_SQL.fin_stmt_tp = 'P'
Group by SYACTFIL_SQL.acct_desc, GLTRXFIL_SQL.trx_dt, GLTRXFIL_SQL.mn_no,GLTRXFIL_SQL.sb_no
Order by GLTRXFIL_SQL.mn_no,GLTRXFIL_SQL.trx_dt;