R パッケージ Spatstat でポイント パターンを作成する際にいくつか問題があります。
> HI06mfav <- read.table("MarHI06mfav.txt", header = TRUE)
> attach(HI06mfav)
The following object(s) are masked _by_ '.GlobalEnv':
x, y
The following object(s) are masked from 'HI06mfav (position 3)':
x, y
> HI06mfav.P <- ppp(x, y, c(-1, 11), c(-1, 11))
Warning message:
In ppp(x, y, c(-1, 11), c(-1, 11)) :
10 points were rejected as lying outside the specified window
> HI06mfav
x y
1 4.100800 6.526913
2 3.710310 6.189953
3 3.030026 6.696919
4 2.747816 6.417674
5 2.955485 6.125787
6 3.299942 5.922913
7 2.932207 5.549772
8 2.681645 5.641663
9 1.858555 5.686039
10 2.069101 5.427891
11 2.387927 5.227459
12 2.530470 5.383951
13 2.783648 5.019703
14 2.219491 4.767310
15 6.591515 8.160451
16 6.600408 8.567767
17 3.098551 3.561141
18 2.634305 3.571341
以前にこの同じコードを使用したことがあり、すべて正常に機能していたため、現在機能していない理由がわかりません。attach() の代替手段を使用する必要があるかもしれないことはわかっていますが、ppp を作成しようとした後のエラーがわかりません。
Spatstat ガイドから直接引用したサンプル コードでも同じことを行います。
> w <- owin(c(-1,1), c(-1,1))
> w <- as.mask(w)
> X <- raster.x(w)
> Y <- raster.y(w)
> M <- (X^2 + Y^2 <= 1)
> pp <- ppp(x, y, c(-1,1), c(-1,1), mask=M)
Warning message:
In ppp(x, y, c(-1, 1), c(-1, 1), mask = M) :
10 points were rejected as lying outside the specified window
> pp
planar point pattern: 0 points
window: binary image mask
100 x 100 pixel array (ny, nx)
enclosing rectangle: [-1, 1] x [-1, 1] units
これを理解するためにspatstatガイドに戻りますが、助けていただければ幸いです。