ImageMagick は透明なピクセルをあらかじめ乗算しています。これにより、以降の変換中にグレーのアウトラインが表示されます。
例えば：
$ convert -size 1085x558 xc:"rgba(0,0,0,0)" PNG32:temp.png
$ composite -gravity center samples/logo_white.png temp.png PNG32:temp.png
これは、 temp.png画像の透明ピクセルが白から黒に変わったことを示すビデオです。
ImageMagick に完全に透明なピクセルを黒に変更するのではなく、そのままにしておく方法はありますか?