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通常の t 検定でエラーが発生しました。

  data <- read.table("/Users/vdas/Documents/RNA-Seq_Smaples_Udine_08032013/GBM_29052013/UD_RP_25072013/filteredFPKM_matrix.txt",sep="",header=TRUE,stringsAsFactors=FALSE)

  PGT <- cbind(data[,2],data[,7],data[,24])
  PDGT <- cbind(data[,6],data[,8])
  pval2 <- NULL
  for(i in 1:length(PGT[,1])){
     pval2 <- c(pval2,t.test(as.numeric(PDGT[i,]),as.numeric(PGT[i,]))$p.value)
     print(i)
  }

エラー：

Error in t.test.default(as.numeric(PDGT[i, ]), as.numeric(PGT[i, ])) : 
  not enough 'x' observations

ベクトルの何が問題なのか理解できません。教えてください。私はそれを理解することができませんでした。

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3 に答える 3

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ほとんどの場合、データにはNA値があります。例えば： - 

x<-rep(NA,4)
t.test(x)

Error in t.test.default(x) : not enough 'x' observations
于 2013-08-06T10:08:09.340 に答える
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あなたのコメントから、欠損値が原因でエラーが発生したようです。を設定することで、欠損値を除外できますna.rm=TRUE。参照:-値がありません。R の質問を投稿する前に、How to make a great R reprobible example? をご覧ください。

于 2013-08-06T12:13:49.833 に答える