私も同様のことをしていますが、ネイティブ ライブラリを zip ファイル内にパックしています。その後、それらを必要とするアーティファクトで、 maven 依存関係プラグインを使用して zip ファイルをプルして解凍します。
<plugin>
<groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
<artifactId>maven-dependency-plugin</artifactId>
<executions>
<execution>
<id>unzip</id>
<phase>prepare-package</phase>
<goals>
<goal>unpack</goal>
</goals>
<configuration>
<artifactItems>
<artifactItem>
<groupId>foo</groupId>
<artifactId>bar</artifactId>
<version>1.0.0</version>
<type>zip</type>
<overWrite>true</overWrite>
<includes>**/*.dll</includes>
<outputDirectory>${project.build.directory}/natives</outputDirectory>
</artifactItem>
</artifactItems>
</configuration>
</execution>
</executions>
</plugin>
ご覧のとおり、分類子は使用していません。