r - ggplot2 で stat_smooth の境界のみを描画する

Question

stat_smooth()withを使用する場合geom_point、影付きのフィット領域を削除する方法はありますが、その外側の境界のみを描画しますか? 次のような方法で影付きの領域を削除できることを知っています。

 geom_point(aes(x=x, y=y)) + geom_stat(aes(x=x, y=y), alpha=0)

しかし、その外側の境界 (外側の曲線) をかすかな黒い線として表示するにはどうすればよいですか?

Answer 1

= NAと併用geom_ribbonすることもできます。fill

gg <- ggplot(mtcars, aes(qsec, wt))+
        geom_point() +  
        stat_smooth( alpha=0,method='loess')

rib_data <- ggplot_build(gg)$data[[2]]

ggplot(mtcars)+
  stat_smooth(aes(qsec, wt), alpha=0,method='loess')+
  geom_point(aes(qsec, wt)) +  
  geom_ribbon(data=rib_data,aes(x=x,ymin=ymin,ymax=ymax,col='blue'),
                fill=NA,linetype=1) 

...そして、何らかの理由で垂直バーが必要ない場合は、2 つのgeom_lineレイヤーを使用できます。

ggplot(mtcars)+
    stat_smooth(aes(qsec, wt), alpha=0,method='loess')+
    geom_point(aes(qsec, wt)) + 
    geom_line(data = rib_data,aes(x = x,y = ymax)) + 
    geom_line(data = rib_data,aes(x = x,y = ymin))

Answer 2

おそらくもっと簡単な方法がありますが、最初はこれを試してみてください。で信頼区間のデータを取得し、ggbuild次に使用しますgeom_line

# create a ggplot object with a linear smoother and a CI
library(ggplot2)    
gg <- ggplot(data = mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) +
    geom_point() +
    geom_smooth(method = "lm")
gg

# grab the data from the plot object
gg_data <- ggplot_build(gg)
str(gg_data)
head(gg_data$data[[2]])
gg2 <- gg_data$data[[2]]

# plot with 'CI-lines' and the shaded confidence area
ggplot(data = mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) +
    geom_point() +
    geom_smooth(method = "lm", se = TRUE, size = 1) +
    geom_line(data = gg2, aes(x = x, y = ymin), size = 0.02) +
    geom_line(data = gg2, aes(x = x, y = ymax), size = 0.02)


# plot with 'CI-lines' but without confidence area
ggplot(data = mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) +
    geom_point() +
    geom_smooth(method = "lm", se = FALSE, size = 1) +
    geom_line(data = gg2, aes(x = x, y = ymin), size = 0.02) +
    geom_line(data = gg2, aes(x = x, y = ymax), size = 0.02)