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サンプル入力:

>Sample GJVT7LS03DEUKL
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGC
>Sample GJVT7LS03CXJ53
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGCGTGACGGGG
>Sample GJVT7LS03DJOYJ
AAACTCC
>Sample GJVT7LS03DMERH
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGCGTGACGGGGGGAC
>Sample GJVT7LS03DN2RB
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGCGTGACGG

私が欲しいもの：

>Sample_1 GJVT7LS03DEUKL
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGC
>Sample_2 GJVT7LS03CXJ53
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGCGTGACGGGG
>Sample_3 GJVT7LS03DJOYJ
AAACTCC
>Sample_4 GJVT7LS03DMERH
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGCGTGACGGGGGGAC
>Sample_5 GJVT7LS03DN2RB
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGCGTGACGG

つまり、パターン (この場合は「サンプル」) に一致する各行にカウント (「_」が前に付いている) を追加したいということです。sed/awk/など。このタスクのワンライナー？

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2 に答える 2

2

考えられる試みの 1 つとして、次のようなものがあります。

$ awk 'BEGIN{a=1}/Sample/ {$1=$1"_"a; a++}1' file
>Sample_1 GJVT7LS03DEUKL
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGC
>Sample_2 GJVT7LS03CXJ53
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGCGTGACGGGG
>Sample_3 GJVT7LS03DJOYJ
AAACTCC
>Sample_4 GJVT7LS03DMERH
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGCGTGACGGGGGGAC
>Sample_5 GJVT7LS03DN2RB
AAACTCCGCAATGCGCGCAAGCGTGACGG

「Sample」を含む各ファイルについて、最初のフィールドを で更新し"_"$variableます。この変数はa最初は 1 に設定されており、その後 1 ずつインクリメントします。

于 2013-08-15T12:53:37.260 に答える