python - ValueError: 文字列を float に変換できませんでした: (バッファ関連?)

Question

凝縮されたコード

# attempt to condense code while preserving the parts
# relevant to the question

from xml.sax import handler, make_parser

class pdosHandler(handler.ContentHandler):
    def __init__(self, data):
        self.data   = data
        self.parts  = { 'energy_values': 0 }
        self.energy_values = []

    def startDocument( self ):
        print "Reading started"

    def startElement(self, name, attrs):
        for key, val in self.parts.iteritems():
            if( name == key ):
                self.parts[key] = 1;

    def characters( self, ch ):
        if self.parts['energy_values'] :
            if ch != '\n':
                self.data.energy_values.append(float(ch.strip()))

def pdosreader(inp, data):
    handler = pdosHandler(data)
    parser = make_parser()
    parser.setContentHandler(handler)
    inFile = open(inp)
    parser.parse(inFile)

    inFile.close()

153 ～ 155 行目:

if( self.parts['energy_values'] ):
    if( ch != '\n' ):
        self.data.energy_values.append( string.atof(normalize_whitespace( ch ) ) )

エラー：

Traceback (most recent call last):
  File "siesta_pdos.py", line 286, in <module>
    main()
  File "siesta_pdos.py", line 278, in main
    pdosreader( args[0], data )
  File "siesta_pdos.py", line 262, in pdosreader
    parser.parse( inFile )
  File "/usr/lib/python2.7/xml/sax/expatreader.py", line 107, in parse
    xmlreader.IncrementalParser.parse(self, source)
  File "/usr/lib/python2.7/xml/sax/xmlreader.py", line 123, in parse
    self.feed(buffer)
  File "/usr/lib/python2.7/xml/sax/expatreader.py", line 207, in feed
    self._parser.Parse(data, isFinal)
  File "siesta_pdos.py", line 155, in characters
    self.data.energy_values.append( string.atof(normalize_whitespace( ch ) ) )
  File "/usr/lib/python2.7/string.py", line 388, in atof
    return _float(s)
ValueError: could not convert string to float:

入力ファイル：

<pdos>
<nspin>2</nspin>
<norbitals>7748</norbitals>
<energy_values>
           -29.99997
           -29.98997
           -29.97996
           ...
           ... (3494 lines skipped)
           ...
             4.97999
             4.98999
             4.99999
</energy_values>
</pdos>

完全な入力: http://dl.dropbox.com/u/10405722/inputfile.dat

完全なコード: http://dl.dropbox.com/u/10405722/siesta_pdos.py

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コードは最初の 3116 個の値を正しく読み取り、エラーで終了します。より短い入力 (たとえば 3000 行) を使用した同じコードでも問題なく動作することに注意してください。 したがって、atof とは関係のないバッファ関連のエラーのように思えます。

何か案が？