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1200 個のプローブ (行) のデータフレームと、それぞれ 9 列の配列の 2 つのセットがあります。最初の 9 列は「ポジティブ」、次の 9 列は「ネガティブ」と名付けられています。ボックス プロットを使用して 12 個のランダムなプローブを選択することにより、式が正常であることを示したいと思います。私のコードは次のようになります。

f<-c(rep("positive", 9), rep("negative", 9))
for(i in seq(from=1, to=1200, by=10)){
    boxplot(probes[i]~f,col="lightblue",main="Expression of genes studied Cells")
}

しかし、次のエラーが発生します。

Error in model.frame.default(formula = probes[i] ~ f) : 
  variable lengths differ (found for 'f')

ボックス プロットを 1 つのプローブに使用すると、問題なく動作します。「ポジティブ」に対応するボックスと「ネガティブ」に対応するボックスの 2 つのボックスを取得します。

f<-c(rep("positive", 9), rep("negative", 9))
genex<-as.numeric(dat.fp.labeled["NM_139321.1_psr1_at",])
boxplot(genex~f,col="lightblue",main="Expression of NM_139321.1_psr1_at samples")
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これは、あなたが望むものだと思います：

set.seed(1)
probes <- data.frame(matrix(rnorm(1200*18),ncol=18))
f<-c(rep("positive", 9), rep("negative", 9))
myrows <- sample(1:1200,12,FALSE)
boxplot(unlist(probes[myrows[1],])~f) # first plot
for(i in myrows){
    boxplot(unlist(probes[i,])~f)
    Sys.sleep(1) # wait for each plot for 1 sec
}
于 2013-08-17T13:05:00.317 に答える