次の方法でSuse(openSuse 12.2 x86_64)サーバーにscikit-learnをインストールしようとすると:
pip install -U scikit-learn
次のエラーが表示されます。
(....)
compile options: '-I/usr/lib64/python2.7/site-packages/numpy/core/include -Isklearn/svm/src/libsvm -I/usr/lib64/python2.7/site-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
gcc: sklearn/svm/libsvm.c
sklearn/svm/libsvm.c:303:31: fatal error: numpy/arrayobject.h: No such file or directory
compilation terminated.
sklearn/svm/libsvm.c:303:31: fatal error: numpy/arrayobject.h: No such file or directory
compilation terminated.
私はすでに試しました:
- gcc を最新バージョン
にインストールする - easy_install を介して、ダウンロードした zip から scikit をインストールする (古いリポジトリを避けるため) - numpy をアンインストールして再インストールする (pip を介して)
scipy (これは numpy の要件です) をインストールしようとすると、同様のエラーが発生します:
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7/fortranobject.c' to sources.
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7' to include_dirs.
error: file '/usr/lib64/python2.7/site-packages/numpy/f2py/src/fortranobject.c' does not exist
どうやら「site-packages/numpy/core/include」の numpy ヘッダーがすべて欠落しています。問題なくpipでnumpyを再インストールしましたが、ヘッダーがまだありません。