散布図を使用して同じ長さの 2 つのデータセットを比較し、指定された p 値を持つ遺伝子のリストに基づいて、発現差のある遺伝子に色を付けたいと思います。より具体的には、以下のようになります。
x 軸をデータ A に、y 軸をデータ B に置き換え、重要な P 値 <0.05) プローブは青色で表示されます。
A = rnorm(100) ### datset A
B = rnorm(100) ### datset B
p = rnorm(100) ### p-values
最初に通常の散布図を作成して、同じ種類のプロットを再現しようとしました。私が元々持っているデータは、15000 プローブ用です。
col = rep('black', length(A))
col[p< 0.05] <- 'blue'
plot(A, B, col=col)