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https://main.g2.bx.psu.edu/でギャラクシー ステッチ MAF ブロック機能を使用します。

1) 私の新規に組み立てられた転写産物の BED ファイルを生成します (座標はヒト参照ゲノムに基づいています。以下の「human_refseq_nooverlap_bed」と呼ばれるファイル)。

2) Galaxy Web サイトにログインします。Get Data -> Upload File -> File Format: "bed", File: click and choose "human_refseq_nooverlap_bed", Genome: "Human Feb. 2009 (GRCh37/hg19) (hg19)"

3) 配置をフェッチ -> MAF ブロックをステッチ -> 間隔を選択: "human_refseq_nooverlap_bed"、MAF ソース: "Locally Cached Alignments"; ここに画像の説明を入力

4) MAF タイプが空です。助けてくれませんか、ありがとう。

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BED ファイルで、属性の編集ボックスで自動検出を確認します。その後、再度 MAF を実行すると、動作するはずです!

于 2014-03-28T14:23:06.547 に答える