python - 共役勾配モジュールの行列関数

Question

共役勾配法を使用して単純な線形問題A*x=bを解いています。不明な x を見つけたいです。

conjGrad は積 Avを返す関数Avを呼び出すことに注意してください 。コードは以下のとおりです。

入力:

• A - 疎行列。二次元配列;
• b - 右側のベクトル。1D 配列。
• x - 初期推測。ここでは、値がゼロの 1D 配列です。

コード：

import numpy as np
import math

A = np.array([[ 0.56244579,  0.        ,  0.        ,  0.        ,  0.52936075,
        0.59553084,  0.        ,  0.        ,  0.        ,  1.1248915 ,
        0.        ,  0.        ,  0.        ,  0.46319065,  0.43672262,
        0.        ],
      [ 0.5       ,  1.        ,  1.        ,  0.5       ,  0.        ,
        0.        ,  0.        ,  0.        ,  0.        ,  0.        ,
        0.        ,  0.        ,  0.        ,  0.        ,  0.        ,
        0.        ],
      [ 0.        ,  0.        ,  0.        ,  0.58009067,  0.        ,
        0.        ,  0.75411788,  0.40606347,  0.        ,  0.        ,
        0.23203627,  0.        ,  0.        ,  0.        ,  0.        ,
        0.        ]])

x = np.array([ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,
    0.,  0.,  0.])

b = np.array([ 3.99464617,  1.81663614,  1.86413003])

def Av(v):
return np.dot(A,v)

def conjGrad(Av, x, b, tol=1.0e-9):
     n = len(b)
     r = b - Av(x)
     s = r.copy()
     for i in range(n):
           u = Av(s)
           alpha = np.dot(s,r)/np.dot(s,u)
           x = x + aplha*s
           r = b - Av(x)
           if(math.sqrt(np.dot(r,r))) < tol:
                 break
           else:
                 beta = - np.dot(r,u)/np.dot(s,u)
                 s = r + beta * s
     return x,i

if __name__ == '__main__':
    x, iter_number = conjGrad(Av, x, b) 


 Traceback (most recent call last):
   File "C:\Python27\Conjugate_Gradient.py", line 59, in <module>
     x, iter_number = conjGrad(Av, x, b)
   File "C:\Python27\Conjugate_Gradient.py", line 47, in conjGrad
     u = Av(s)
   File "C:\Python27\Conjugate_Gradient.py", line 40, in Av
     return np.dot(A,v)
 ValueError: matrices are not aligned

このメッセージを回避する簡単な解決策はありますか? どんな答えでも大歓迎です