webpageの cmd として topGO パッケージをインストールしようとしました:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("topGO")
しかし、以下のようにいくつかのエラーがあります。
エラー: .onLoad が「GO.db」の loadNamespace() で失敗しました。詳細: 呼び出し: sqliteExecStatement(con、ステートメント、bind.data) エラー: RS-DBI ドライバー: (ステートメントのエラー: ディスク I/O エラー) エラー:ロードに失敗しました 実行が停止しました エラー: ロードに失敗しました
次に、Webページの指示としてRにGO.dbパッケージをインストールしたい
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("GO.db")
そして、私は上に投稿したのと同じ問題に対抗します:
警告: 'sort' で複数のメソッド テーブルが見つかりました 警告: 'rank' で複数のメソッド テーブルが見つかりました 警告: 'as.data.frame' で複数のメソッド テーブルが見つかりました 警告: 'unlist' で複数のメソッド テーブルが見つかりました 警告: 複数のメソッド テーブルが見つかりました「一致」エラー: .onLoad が「GO.db」の loadNamespace() で失敗しました、詳細: 呼び出し: sqliteExecStatement(con、ステートメント、bind.data) エラー: RS-DBI ドライバー: (ステートメントのエラー: データベースがロックされています)エラー: 読み込みに失敗しました 実行が停止しました エラー: 読み込みに失敗しました
これは、R で sessionInfo() を入力した後の出力です。
R バージョン 3.0.1 (2013-05-16) プラットフォーム: x86_64-unknown-linux-gnu (64 ビット)
ロケール: [1] LC_CTYPE=zh_CN.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=zh_CN.UTF-8 LC_COLLATE=zh_CN.UTF-8 [5] LC_MONETARY=zh_CN.UTF-8 LC_MESSAGES=zh_CN.UTF-8 [ 7] LC_PAPER=C LC_NAME=C [9] LC_ADDRESS=C
LC_TELEPHONE=C [11] LC_MEASUREMENT=zh_CN.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C付属の基本パッケージ: [1] 並列統計グラフィックス grDevices utils データセット メソッド [8] 基本
その他の添付パッケージ: [1] AnnotationDbi_1.22.6 Biobase_2.20.1
BiocGenerics_0.6.0 [4] BiocInstaller_1.10.3名前空間を介してロードされた (アタッチされていない): [1] DBI_0.2-7
IRanges_1.18.3 RSQLite_0.11.4 stats4_3.0.1 tools_3.0.1
GO.db パッケージのインストールに問題があると思います。アドバイスをいただければ幸いです。ありがとう