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医用画像では、巨大なギガピクセル画像を保存する方法が 2 つあります。

  1. 大量の JPEG 画像 (ファイルにパックされているか個別に) を使用し、奇妙なインデックス形式を作成して、何がどこにあるのかを説明します。いくつかのメタデータを他の形式で追加します。

  2. TIFF のタイルと複数画像のサポートを使用して、画像を 1 つのファイルとしてきれいに保存し、ズーム速度のためにダウンサンプリングされたバージョンを提供します。次に、さまざまな TIFF タグを悪用して、非標準的な方法でメタデータを保存します。また、後で個別に変換する必要がある重なり合う境界を持つタイルを保存します。

どちらの場合も、読者は形式を十分に理解して、物事の描き方とメタデータの読み方を理解する必要があります。

これらの画像を保存するより良い方法はありますか? TIFF (またはBigTIFF ) はまだこれに適した形式ですか? XMPはメタデータの問題を解決しますか?

主な問題は次のとおりです。

  • 高速ランダム アクセス (タイリング) を可能にする方法で画像を保存する
  • 高速ズーム (ピラミッド) 用にダウンサンプリングされた画像を保存する
  • タイルが重なっている場合やまばらな場合の処理​​ (スキャナーは、多くの場合、カメラを 2D のスライド上で動かし、画像化するものがある場所だけをキャプチャすることで機能します)
  • スライドのラベルやサムネイルなどの関連画像を含む重要なメタデータの保存
  • 非可逆ストレージのサポート

大規模な航空写真や地図を保存するために人々はどのような種類の (できれば非独占的な) 形式を使用していますか? これらの画像には類似した特性があります。

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TIFFまたはBigTIFFから始めて、タグの有用なサブセット+XMPメタデータを定義することが道のりかもしれません。FITSは基本的にロスレスデータ用であり、適切なメタデータメカニズムがないため、適切ではありません。

TIFFの問題は、柔軟性が高すぎることですが、TIFFのサブセットは許容できるはずです。

解決策は、 http ：//ome-xml.org/およびhttp://ome-xml.org/wiki/OmeTiffである可能性があります。

DICOMが現在サポートしているようです：ftp： //medical.nema.org/MEDICAL/Dicom/Final/sup145_ft.pdf

于 2009-12-30T23:00:45.603 に答える
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おそらくFITSが必要です。

  • 任意サイズ
  • 1～3次元データ
  • 広範なヘッダー
  • 天文学で広く使用されており、NASA と IAU によって承認されています
于 2009-12-15T06:30:08.387 に答える
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私は病理学者 (そして愛好家のプログラマー) であるため、仮想スライドとデジタル病理学に大きな関心を持っています。OpenSlide プロジェクトに興味があるかもしれません。彼らは、大手ベンダー (Aperio、BioImagene など) の多数の独自フォーマットを特徴付けました。ほとんどは、ズームされたピラミッド型 (もちろん、さまざまな顕微鏡対物レンズでスキャン)、複数のタイル化された tiff を含む大きな tiff ファイル、または圧縮された (JPEG または JPEG2000) 画像で構成されているようです。

于 2009-12-17T17:45:01.497 に答える
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業界標準はDICOM Sup 145です。ベンダーに採用してもらうのは遅いですが、さらに別のフォーマットを発明してもおそらく役に立たないでしょう.

于 2013-09-13T16:26:32.307 に答える
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PNGがうまくいくかもしれません。大きな画像、メタデータを処理でき、PNG 形式にはいくつかのインターレースを含めることができるため、n/8 xn/8 のダウンサンプリングされた画像を非常に簡単に取得できます。

PNG が高速ランダム アクセスを実行できるかどうかはわかりません。チャンクされていますが、それだけでは不十分な場合があります。

透明度チャネルを使用してまばらなデータを表すことができます。

于 2009-12-15T06:11:01.317 に答える
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JPEG2000 は一見の価値があるかもしれません。この分野における国立図書館の興味深い取り組みです。

于 2012-01-09T03:21:37.577 に答える